MicroRNA(miRNA)是一种重要的非编码RNA分子,在生物体内广泛参与基因表达调控过程。随着研究的深入,miRNA在疾病诊断、治疗以及基础生物学研究中的价值日益凸显。因此,高效提取高质量的miRNA成为科研工作的重要环节之一。以下是针对miRNA提取的一套通用方法和具体操作步骤。
一、实验前准备
1. 材料选择:根据研究目的选择合适的样本类型,如血液、组织或细胞等。
2. 试剂准备:确保所有使用的试剂均为无RNA酶污染的产品,并提前准备好TRIzol Reagent或其他适合提取小RNA的试剂盒。
3. 仪器校准:检查并调试高速冷冻离心机、紫外分光光度计等相关设备,确保其处于最佳工作状态。
二、样本处理
1. 样本采集与保存:迅速将新鲜样本置于液氮中快速冷冻后转移至-80℃长期储存;若为血液样本,则需立即加入抗凝剂防止凝固。
2. 细胞裂解:对于细胞样本,先用PBS清洗掉培养基,然后加入适量胰蛋白酶消化收集细胞,再用PBS洗涤两次去除残留物。
3. 组织匀浆:将冷冻保存的组织块放入预冷的研磨管内,使用电动组织匀浆器进行充分研磨直至完全破碎。
三、RNA提取
1. 裂解与沉淀:向上述制备好的样本中加入足量的TRIzol试剂,充分混合均匀后静置5分钟以使蛋白质变性。随后加入氯仿溶液,剧烈震荡混匀后于4℃条件下以12,000 rpm离心15分钟。
2. 上清液收集:小心吸取上层水相至新的离心管中,避免接触中间层物质。
3. 异丙醇沉淀:向该水相中加入等体积的异丙醇,轻轻颠倒混匀后放置室温下静置10分钟。
4. 离心回收:以12,000 rpm离心10分钟,弃去上清液,保留沉淀。
5. 75%乙醇洗涤:加入1毫升75%乙醇洗涤沉淀,再次以7,500 rpm离心5分钟,倾倒掉多余的液体。
6. 干燥与溶解:将沉淀置于通风橱中自然晾干几分钟,然后用适量DEPC处理过的双蒸水重新溶解。
四、质量检测
1. 浓度测定:利用紫外分光光度计测量所提RNA样品的吸光值A260/A280比值,正常情况下该比值应在1.8-2.0之间。
2. 完整性评估:通过琼脂糖凝胶电泳观察RNA条带分布情况,良好的miRNA应呈现清晰的小RNA带。
五、注意事项
- 整个过程中必须保持严格的无菌操作,避免外源性RNase对样品造成破坏。
- 每一步骤均需严格按照说明书执行,特别是试剂的比例控制和温度调节。
- 如果需要长期保存提取得到的miRNA,请将其存放于-80℃环境中。
以上便是关于MicroRNA提取的基本方法及其详细步骤介绍。希望这些信息能够帮助您顺利完成相关实验任务!