在企业日常经营中，涉及到增值税的计算时，经常会遇到一个问题：当存在商业折扣的情况下，究竟应该先扣除商业折扣，然后再按照剩余金额计算增值税，还是可以直接以商品原价为基础计算增值税呢？这个问题看似简单，但实际上需要结合税法规定和实际操作进行深入分析。

首先，我们需要明确商业折扣的概念。商业折扣是指企业在销售商品或提供服务时，为了促销或其他目的而给予客户的减让。这种减让通常体现在价格上，即客户支付的实际金额低于商品标价。根据我国《增值税暂行条例》及其实施细则的规定，在计算增值税时，销售额应为纳税人发生应税销售行为向购买方收取的全部价款和价外费用，但不包括增值税本身。

因此，从理论上讲，如果存在商业折扣，则应在确定销售额之前将其从总价中扣除。具体来说，就是先按照实际收到的款项（即扣除商业折扣后的金额）作为销售额，然后以此为基础乘以适用税率来计算增值税。例如，某企业销售一批货物，原价为10万元，给予客户10%的商业折扣后实际收款为9万元。在这种情况下，应将9万元视为销售额，并据此计算增值税。

然而，在实际操作过程中，可能会遇到一些特殊情况。比如，某些行业或地区可能存在不同的习惯做法，或者由于会计处理方式的不同而导致计算结果有所差异。此外，对于一些复杂交易结构，如捆绑销售、赠品赠送等，也可能对如何正确处理商业折扣产生影响。

为了避免因理解偏差而导致税务风险，建议企业在制定相关政策时参考最新的税收政策文件，并咨询专业税务顾问的意见。同时，还应注意保留相关凭证和记录，以便在必要时能够证明所采用的方法符合法律规定。

综上所述，在算增值税时，如果有商业折扣存在，应当先扣除商业折扣后再计算增值税。这一原则既符合税法的要求，也便于企业规范财务管理。希望以上内容能帮助大家更好地理解和应对这类问题。